含有葉綠素和藻藍素。藍細菌與其它光合細菌最大的區別是，其它光合細菌在光合過程中不會放出氧氣，而藍細菌卻能源源不斷地往空中輸送氧氣。經過長期不斷地釋放氧氣，終于改變了大氣的組成，進而在高空形成臭氧層，擋住了紫外線，為以后的需氧生物提供了有利的生存環境，并為海洋生物登陸提供了條件。

1藍細菌

藍細菌的細胞一般比細菌大，通常直徑為3～10μm，最大的可達60μm，如巨顫藍細菌。根據細胞形態差異，藍細菌可分為單細胞和絲狀體兩大類。單細胞類群多呈球狀、橢圓狀和桿狀，單生或團聚體，如粘桿藍細菌和皮果藍細菌等屬;絲狀體藍細菌是有許多細胞排列而成的群體，包括：有異形胞的(如魚腥藍細菌屬)，無異形胞的(如顫藍細菌屬)，有分支的(如費氏藍細菌屬)。

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